虽然阴茎的大小因人而异，并且有一定的医学标准，但也确有睾丸发育正常但阴茎比较短小的情况，即使能够勃起和射精，也很容易造成性心理异常。
造成阴茎短小的因素1.遗传因素：阴茎的大小受遗传基因的控制与影响。
2.发育与营养状况不良：体格健壮、身材高大的男性，外生殖器发育好，阴茎可能较为粗大，反之则可能小一些，但阴茎的大小不一定会与身高成正比关系。
3.肥胖：如果小腹部、耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出，阴茎的发育往往欠佳，阴茎会相对短小。
4.其他因素：其他因素如内分泌紊乱、男性激素水平不足、阴阜或阴囊肿胀产生的阴茎“回缩”等，都可能造成阴茎短小。
